Genetische analyse Stabij en Markiesje

Hier kunnen jullie lekker kletsen. Dit board is dus niet bedoeld voor serieuze voedings/gezondheidsvragen!

Moderators: Lizzy, Charlie Angel, eelke

Omlaag
Barfplaats
Gesponsord bericht

Genetische analyse Stabij en Markiesje

Berichtdoor Barfplaats

Gebruikersavatar
Thessa en Shanti
5-sterren
Berichten: 1892
Lid geworden op: Vr 27 Apr 2012, 17:09
Locatie: Omgeving Zwolle

Genetische analyse Stabij en Markiesje

Berichtdoor Thessa en Shanti » Wo 27 Jan 2016, 21:23

De stambomen en erfelijke ziektes bij de Stabij en het Markiesje zijn geanalyseerd door een student van de WUR. Omdat het rapport denk ik ook wel interessant is voor mensen die niks met deze rassen hebben deel ik het hier. :)

Ik moet zeggen dat de cijfers van de stabij mij wel verbaasde. Dat ook de stabij er genetische gezien niet heel goed voorstaat had ik wel verwacht maar dat het bijna net zo erg is al de bij wetter dan weer niet omdat de populatie veel groter is.
Zo zijn er van de 30 founders nog maar 14 over in de genenpoel en 5 dieren zijn verantwoordelijk voor 86% daarvan. Hopelijk lukt het om net als bij de wetter outcross en aankeuringen te doen en kunnen de rasverinigingen daarbij samenwerken.


NVSW:
Genetische analyse van de Stabijhoun
Op verzoek van de NVSW heeft de Universiteit van Wageningen een genetische analyse gemaakt van de Stabijhoun populatie. Op 20 januari zijn de resultaten daarvan openbaar geworden. Conclusie was dat de genetische diversiteit van de Stabijhoun zeer beperkt is en dat maatregelen nodig zijn. Er is een aantal aanbevelingen gegeven. Het belangrijkste en meest vergaande is dat er geadviseerd wordt om een outcross programma op te zetten met zowel look-alikes (wel DNA-testen) als andere rassen. Een werkgroep zal deze aanbevelingen bestuderen en komen met voorstellen richting bestuur en ledenvergadering.
We hebben de andere rasvereniging uitgenodigd om deel uit te maken van deze werkgroep zodat het een gezamenlijke werkgroep wordt van beide rasverenigingen. Ook hebben we de RvB op de hoogte gebracht van dit onderzoek.


Samenvatting
De sterke artificiële selectiedruk en het fokken in (kleine) gesloten populaties heeft in veel hondenrassen geleid tot een hoog inteeltniveau, een lage genetische diversiteit en verschillende erfelijke aandoeningen. In deze studie zijn twee Nederlandse hondenrassen, het Markiesje (stamboek sinds de jaren zeventig) en de Stabij (stamboek sinds de jaren veertig), geanalyseerd met als doel tot aanbevelingen te komen die de rasverenigingen kunnen bijstaan in het behouden van de genetische diversiteit en het verbeteren van het dierenwelzijn in de rassen. Eerst is een stamboekanalyse uitgevoerd, waarbij algemene kengetallen en parameters met betrekking tot genetische diversiteit zijn berekend. Daarna is de prevalentie van erfelijke aandoeningen in de rassen geschat. Als laatste is het effect van diverse fokstrategieën op de inteelttoename in kaart gebracht met computersimulaties.
Het Markiesje is een klein ras met jaarlijks ongeveer 120 geboren pups. Meer dan een kwart (26,2%) van de mannetjes en meer dan een derde (36,7%) van de vrouwtjes werd tot nu toe geselecteerd voor de fok. De gemiddelde worpgrootte was 4,2 pups en het generatie-interval 3,4 jaar. De Stabij is een groter ras met ongeveer 700 pups per jaar. Rond een dertiende (7,8%) van de mannetjes en een zesde (17,8%) van de vrouwtjes werd tot nu toe geselecteerd voor de fok. De gemiddelde worpgrootte was 6,3 pups en het generatie-interval 4,4 jaar. Van de genetische diversiteit die aanwezig was in de 54 basisdieren in het Markiesje en de 30 basisdieren in de Stabij is respectievelijk 13% en 33% verloren gegaan. Gedurende het overgrote deel van de tijd dat de rassen bestaan is de inteelttoename per generatie in beide rassen ver boven de 1% geweest (effectieve populatiegrootte < 50), een waarde die als ondergrens wordt gebruikt om aan te geven dat een ras een onaanvaardbaar hoog risico loopt op de accumulatie van erfelijke aandoeningen. De inteelttoename en verwantschapstoename nemen echter wel af in de rassen. Het effectieve aantal basisdieren en het genoom equivalent waren respectievelijk 14,6 en 4,1 voor het Markiesje en 6,3 en 1,5 voor de Stabij, wat aangeeft dat een groot deel van de genetische diversiteit verloren is gegaan door een onevenredige bijdrage van de basisdieren en door genetische flessenhalzen. In het Markiesje zijn twee basisdieren gevonden die samen verantwoordelijk zijn voor 31% van de genenpoel, 46% van de gemiddelde inteeltcoëfficiënt en 44% van de gemiddelde verwantschap van de Markiesjes geboren in 2010-2015. In de Stabij zijn vijf basisdieren gevonden die samen verantwoordelijk zijn voor 86% van de genenpoel, 95% van de gemiddelde inteeltcoëfficiënt en 95% van de gemiddelde verwantschap van de Stabijs uit 2010-2015. Drie erfelijke aandoeningen zijn geanalyseerd in het Markiesje: patella luxatie (PL; geschatte prevalentie van 21,7%), progressieve staafjes-kegeltjes degeneratie (PRCD; 1,4%) en een neuropathologie (0,8%). PL is polygeen en PRCD is monogeen autosomaal recessief. De oorzaak van de neuropathologie is onbekend maar het wordt verondersteld dat deze aandoening ook monogeen autosomaal recessief is. In de Stabij zijn zes erfelijke aandoeningen geanalyseerd: heupdysplasie (HD; 20.8%), elleboogdysplasie (ED; 18.8%), epilepsie (0.9%), persisterende ductus arteriosus (PDA; 0.8%), cerebrale dysfunctie (CD; 0.6%) en de von Willebrand ziekte type-I (vWD-I; 69.8%). HD, ED, epilepsie en PDA zijn polygeen en CD en vWD-I zijn monogeen autosomaal recessief. Met behulp van computersimulaties is laten zien dat de huidige fokrestricties van de rasverenigingen effectief zijn in het beperken van de inteelttoename, met name in de Stabij (waarbinnen geregeld populaire reuen overmatig zijn gebruikt). Het vergroten van de fokpopulatie was in absolute aantallen vooral effectief in de kleinere populatie van Markiesjes. Sturen op verwantschap was zeer effectief in het beperken van de inteelttoename in beide rassen. Concluderend is de huidige populatiestatus van en de genetische diversiteit in beide rassen verre van optimaal. Aan de rasvereniging van de Stabij wordt aangeraden om ofwel consequent op verwantschap te sturen ofwel systematisch uit te kruisen met andere rassen. Dit om de (toename) in de verwantschap te verminderen. Aan de rasvereniging van het Markiesje wordt aangeraden om door te gaan met het inkruisen van look-alikes en de populatie zo te laten groeien, zonder dat hierbij de verwantschap sterk toeneemt. Overige aanbevelingen zijn te vinden in de conclusie van dit rapport.

Bron, het volledige rapport
enya13
3-sterren
Berichten: 188
Lid geworden op: Za 05 Dec 2015, 22:40

Re: Genetische analyse Stabij en Markiesje

Berichtdoor enya13 » Do 28 Jan 2016, 00:40

interessant, bedankt.
Lizzy
Moderator
Berichten: 55240
Lid geworden op: Ma 24 Mar 2003, 19:28
Contact:

Re: Genetische analyse Stabij en Markiesje

Berichtdoor Lizzy » Do 28 Jan 2016, 08:18

Super bedankt voor het plaatsen! Ja, dit is mega interessant en zouden ze met ieder ras moeten doen. Ik denk trouwens dat je met veel rashonden je de blubber schrikt over wat er aan founders is en wat er daarvan is overgebleven in de huidige populatie.....
Gebruikersavatar
Thessa en Shanti
5-sterren
Berichten: 1892
Lid geworden op: Vr 27 Apr 2012, 17:09
Locatie: Omgeving Zwolle

Re: Genetische analyse Stabij en Markiesje

Berichtdoor Thessa en Shanti » Do 28 Jan 2016, 14:46

Waarschijnlijk wel maar volgens mij steken de meeste rasverenigingen de kop in het zand in plaats van hun ras eens goed te laten onderzoeken.
Dit is door een student gedaan als thesis dus het lijkt me dat dat wel vaker te regelen moet zijn met universiteiten. Bij de wetter hebben de universiteiten van Wageningen en Utrecht ook geholpen.
Gebruikersavatar
Borke
5-sterren
Berichten: 8035
Lid geworden op: Vr 03 Sep 2004, 17:12
Contact:

Re: Genetische analyse Stabij en Markiesje

Berichtdoor Borke » Ma 15 Feb 2016, 09:07

Het verbaast mij niet en ik denk dat het bij veel, zo niet alle rassen, aan de hand is.

Bij de Stabij zijn 40% van de fokdieren afgevallen toen ze op HD zijn gaan testen.
Daarbij zijn er nu 2 rasverenigingen in een klein land als Nederland, wat de genetische diversiteit ook niet ten goede komt.

Daarbij zie je bij alle rassen dat de 2e wereldoorlog de genetische diversiteit ook niet heeft vergroot. Als je zelf voor je leven vreest en niets te eten hebt, dan ga je niet fokken...

Zelf heb ik Maine Coon katten gefokte en daar meegewerkt aan de opbouw van een grote internationale database (Pawpeds).
Bij de Maine Coons in Pawpeds kan je precies zien wat de stamboomopbouw is met founders etc.
De Stabij zit daar helaas niet bij.

Wat me al opviel, is dat er bij de Maine Coons veel meer outcross mogelijk is dan bij de Stabij.

Gezonde rasdieren fokken wordt een steeds grotere uitdaging...

Ik herinner me een lezing over genetica bij onze kattenvereniging van 20 jaar geleden.
Daar werd als voorbeeld de Yorkshire terrier aangehaald.
Blijkbaar werd daar toen veel willekeurig mee gefokt, want in die tijd had "iedereen" zo'n hondje vertelde hij. Er werd niet echt gelet op rasstandaard, grootte etc en ze waren volgens zijn zeggen gezonder dan andere rassen...
Fokkers kunnen heel goedbedoeld van alles kapot maken...
Barfplaats
Gesponsord bericht

Re: Genetische analyse Stabij en Markiesje

Berichtdoor Barfplaats


Terug naar “Bar-plaats”

Wie is er online

Gebruikers op dit forum: AnnemiekevD, cj, Google [Bot], MarijeEnBoomer, marnou, src_esther en 11 gasten